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19/06/2023 - Formation ISIA - 26 juin à 14h - Module gestion de projets et Formulaires d'accès


Merci à tous les participants de notre première session de formation ISIA, et à l’équipe OLA pour leur retour d’expérience sur le déploiement d’ISIA sur leur plateforme ! Retrouvez les supports de présentation et vidéo sur notre espace Nextcloud : https://nextcloud.inrae.fr/s/KcsN6WsBkesEjSx

La prochaine session de formation ISIA se déroulera le lundi 26 juin à 14h et aura pour intitulé : « de PPA* à l’espace projet : fonctionnalités du module de gestion de projet et construction de formulaires d’accès personnalisés ». Les formations suivantes seront délivrées à une fréquence d’environ une formation toutes les deux semaines (avec quelques ajustements selon les disponibilités des participants pendant l’été).

Retrouvez les autres formations en ligne sur la chaine Youtube d’AnaEE France

Retrouvez nos autres documents en ligne sur le Nextcloud AnaEE France : https://nextcloud.inrae.fr/s/tALRPaRcmywKtN3


Alyssa et Florent,
Pour l’équipe ISIA

*PPA : formulaire de dépôt de projet standardisé proposé par AnaEE France « Project Proposal Administration »

02/06/2023 - A partir du 12/06 - Formation ISIA - Module de gestion de projet

Chères/Chers collègues AnaEE France,

Les formations ISIA reprennent !
Après une 1ère session de formation sur le dépôt de projets et la gestion des ressources, le déploiement de l'application ISIA se poursuit.
Vous êtes maintenant tous tenus de saisir l'ensemble de vos projets dans l'application, mais que faire de ces projets ?
Nous pouvons maintenant vous proposer des outils de gestion de projet pour assurer le suivi, faciliter le reporting, collecter les métadonnées "projet",...
A partir du 12 Juin prochain à 14h, nous allons donc repartir sur une session de formation sous la forme de visioconférence d'1 heure avec une partie de démonstration et une autre dédiée aux questions.

Nous commencerons par un retour d'expérience des unités qui utilisent ISIA et une présentation du programme  de cette 2ème session.
Ces sessions seront hebdomadaires et bien entendues enregistrées et disponibles sur la chaîne You Tube d'AnaEE-France.
En espérant vous retrouver nombreux pour ces sessions de formation, 
Bon weekend,

Florent Massol et Alyssa Clavreul,
Pour l'équipe ISIA d'AnaEE France

21/02/2023 - New release 2.10.0

A new version has just been released. You can find all the improvements and corrections by clicking on the version number at the bottom of the page or via this link

Main updates

- Networks catalog

- Notification parameters

- PPA custom


16/12/2022 - AnaEE platforms Catalog workshops, ISIA and SEISM

On Wednesday 15 December, the second workshop for the implementation of the new AnaEE platform catalogue was held.

This second session welcomed about thirty participants who were able to attend a short training session on how to use the ISIA tool and then be guided to connect and enter or update their information.

Before you start using a new web application as we did during the first session, it is surely important to explain briefly the functionalities of the application and how we will use it in the European networks that we are integrating for the first time for many of us.

A network of platforms has been created in France on the model of AnaEE. During the first meetings of the network, we began to discuss our common activities but also the growing demands on the good management of our platforms, the quality of the data we produce and, more broadly, the quality of the services we provide to the research world.
We all agree that this is the goal of scientific excellence that we are all striving for.
But in a field like ours, things change very quickly and the amount of new requirements becomes exponential when projects become multi-platform and data has to be open.
As everyone's workload is already heavy, it soon became clear that it would be difficult to take this step without the help of suitable tools.
Indeed, tools do exist. These range from spreadsheets to tools dedicated to certain functionalities, but free software offers few possibilities for compatibility and integration without a substantial investment.
We have therefore decided to develop our own application in which we will be able to integrate the functionalities we need to maintain our platforms on a day-to-day basis but also to host the projects of research teams.

We started from what we defined as the core business of our platforms: "Producing quality data that can be reused by everyone".
Then we asked ourselves what metadata is needed to describe the context of production of these data.
Of course, it is essential to describe the ecosystem studied and the experimental protocol that will allow us to verify the scientific hypotheses, but if we want the data to be reusable, we need to describe all the parameters measured, not only to verify that the treatments have been applied, but above all how we measure their effects.
It is therefore necessary to be able to describe all the instrumentation, the sampling and calibration procedures, etc. that were used, as well as the events in the laboratory notebook.
For long-term observation devices, it is sufficient to describe all this once, but as soon as the projects multiply, this work can become tedious as soon as we have to enter it in our data management plans and then when the data are used and deposited in the warehouses.
This is why we have developed a tool to facilitate the collection, structuring and FAIRisation of all this metadata.

The ISIA tool is composed of the following functionalities
- management of multi-service and multi-platform projects,
- management of the resources that will be mobilised to carry out the projects,
- extraction and FAIRisation of metadata,
- catalogues describing our platforms, services and resources,
- indicator tables to facilitate reporting and the maintenance of our resources.

Some features are operational and others are under development.

So we don't use SEISM anymore? you might ask.

In fact, SEISM is a particular configuration of the ISIA application dedicated to the Central Hub of a network of experimental platforms.
For the ERIC AnaEE, it has the particularity :
- centralising project submissions,
- organise their evaluation,
- distribute projects to the platforms involved.

The application and its functionalities are evolving at the same time as we have to integrate new ways of working, notably within the newly formed ERIC AnaEE and now the AgroServ network. The creation of these networks is a real opportunity for our platforms and the support given to the development of tools like ISIA will allow us to accompany them in these new challenges.
This is why you will all contribute to the development and progressive deployment of functionalities that will aim at facilitating the evaluation and monitoring of the implementation of multi-platform projects that we are now proposing on a European scale.
Of course, we will face some obstacles. Indeed, the deployment of new developments can sometimes be perilous.
We hope that you will let us know about the dysfunctions but also about your expectations on the improvements of the ISIA tool, we will try to answer your requests as well as possible.

Best regards to all.

Florent and the ISIAns.

24/10/2022 - Nouvelle version : 2.9.7

Une nouvelle version vient d'être mise en ligne. Vous trouverez toutes les améliorations et corrections en cliquant sur le numéro de version en bas de page ou via ce lien

10/10/2022 - Nouvelle version : 2.9.6

Une nouvelle version vient d'être mise en ligne. Vous trouverez toutes les améliorations et corrections en cliquant sur le numéro de version en bas de page ou via ce lien

Principales mises à jours

  • Amélioration des modals
  • Exportations des formulaires
  • Amélioration du Gantt dans le mode projet
  • Amélioration de l'arborescence JS dans les ressources (plus rapide)


15/09/2022 - Nouvelle version : 2.9.5

Une nouvelle version vient d'être mise en ligne. Vous trouverez toutes les améliorations et corrections en cliquant sur le numéro de version en bas de page ou via ce lien


22/02/2022 - Formation ISIAv2 tous les Mardi de 14h à 15h !

La nouvelle version d'ISIA propose maintenant, en plus du module de dépôt de projet (PPA), un module de gestion de ressources.

Les personnels des plateformes peuvent maintenant gérer leurs équipements, leurs locaux, leurs documents, leurs échantillons, .... dans l'application. La gestion de ces ressources permettra de les mobiliser pour la réalisation des projets scientifiques et enrichir la description des contextes de production des données.

Nous tenons donc des sessions de formation tous les Mardi de 14h à 15h dans lesquelles nous abordons les configurations des différentes fonctionnalités du module de gestion des ressources ;

  • création d'un type de ressources
  • arborescence des ressources
  • Formulaire de description
  • calendrier associé
  • liens entre ressources
  • système de tickets

Vous pouvez nous y retrouver en visioconférence en suivant ce lien :


Les sessions étant enregistrées, vous pouvez les visionner ultèrieurement sur la chaîne YouTube AnaEE-France :


Nous espérons vous y retrouver le plus nombreux possibles, non seulement pour vous apprprier ce nouvel outil mais aussi pour nous aider à l'améliorer.

A bientôt.

L'équipe ISIA.

26/10/2020 - Mise en service du nouveau module de dépôt de projet d'ISIAv2.0

Bonjour à tous,

comme nous vous l'avons annoncé, vous trouverez maintenant, sur ce portail de l'application ISIAv2.0, le nouveau formulare en ligne de soumission de projet ainsi qu'un espace dédié à votre infrastructure comprenant un interface de gestion des projets soumis et des utilsateurs.

Cette nouvelle version du module PPA n'offre que très peu d'évolutions par rapport à la 1ère version et vous pourrez facilemet la prendre en main grâce au cas d'utilisation n°1 que vous trouverez dans l'onglet "Documentaton", en haut de la page d'accueil de l'application.

Nous restons à votre écoute, à travers le Gitlab de l'application dont l'accès se trouve sur la page d'accueil, pour recueillir vos remarques et suggestions d'améliorations.

L'équipe ISIA.

25/10/2020 - ISIA fait peau neuve avec sa version 2.0

Bonjour à toute la communauté d'AnaEE-France !

Eh non ! Le projet de développement de l'application ISIA n'est pas mort !

Après un coup d'arrêt marqué par le départ de l'ancien chef de projet, le projet a été relancé par une nouvelle équipe de développement en 2018. Cette 1ère version d'ISIA nous a permis de mieux identifier les besoins des infrastructures d'AnaEE-France mais aussi les manques de l'application, qui proposait seulement un module de soumission de projet destiné aux équipes scientfiques porteuses de projet.

Aprés un gros travail de restructuration comprenant :

  • la création d'un système d'authentification commun aux utilisateurs d'AnaEE-France grâce à un annuaire LDAP,
  • la mise en place de Dockers pour faciliter la sauvegarde, la restauration et la maintenance de l'application,
  • la fusion des bases de données et la restructuration du code pour prévenir les mises à jour logicielles,
  • la création d'un formulaire en ligne de soumission de projet,
  • l'amélioration de la gestion des rôles des utilisateurs,
  • le changement de philosophie de l'application maintenant destinée aux personnels gestionnaires des plateformes,

nous sommes maintenant prêts à vous proposer progressivement la "partie visible" d'ISIAv2.0.

En effet, nous allons successivement déployer les différents modules de l'application. Lorsqu'un module est déployé, le module suivant est à l'épreuve de notre équipe de testeurs pendant qu'un nouveau module est en phase de développement.

Le module de soumission de projet est la 1ère étape de ce déploiement et même si ce module n'offre pas beaucoup d'évolutions par rapport à la version v1.0 de l'application, il sera suivi par :

  • un module de gestion des ressources des plateformes
  • un module de gestion des rôles utilisateurs et de leurs droits d'accès,
  • un 1er module de gestion de projet avec planificateur d'expérience et cahier de laboratoire,
  • une extension du module de gestion de projet avec espace collaboratif et éditeur de plan de gestion des données,
  • un tableau de bord des indicateurs,
  • un module d'extraction des données et métadonnées d'un projet avec annotation sémantique.

Le rythme de déploiement dépendra bien sûr des moyens que l'équipe projet arrivera à mobiliser pour développer puis maintenir ISIA, mais aussi et surtout, de votre intérêt pour cette nouvelle application, qui intègre beaucoup d'outils dont nous avons tous besoin sur nos plateformes. L'objectif est de rendre plus systématique la traçabilité et la mise en oeuvre d'une démarche qualité et le reporting mais aussi produire des jeux de données enrichis de toutes les métadonnées nécessaires à leur réutilisation (données FAIR).

Nous espérons tous que ce projet d'application à destination de la communauté scientifique de recherche en écologie permettra de fluidifier les échanges, les partages et la création de connaissances pour la communauté scientifique mais aussi des différents acteurs de la société.

Nous souhaitons donc que cette aventure commune dure le plus longtemps possible et nous restons à votre écoute pour développer les outils qui correspondent à vos attentes et participent à l'amélioration du quotidien des plateformes, de leurs personnels et des équipes de recherche qui viennent les utiliser.

A bientôt,

L'équipe ISIA.